樱井唯曾经认为数码宝贝是一个真实的世界。
可后面樱井唯发现，数码宝贝世界是一个虚拟世界，这个世界以现实世界为蓝本孕育于人类的计算机虚拟世界之中，数据在虚拟的空间里实体化，这里居住的都是各种人类世界元素解构再结合并且获得意识后所构成的数码宝贝。
因此对数码宝贝世界而言程序是十分重要的，樱井唯目睹了在小丑兽威逼下，分子兽以「螺旋之山」为蓝本设计了一道程序。
这道程序能够将数码世界所有的情报，以都市、森、海、暗四种对应黑暗四天王自己的属性分别进行世界再筑构，并且在世界正中央隆起一座四属性的螺旋山。那座山被称为黑暗龙卷山。
这种让整个数码世界全体都改变的程序运作，当然要有相应的强大能量，而这股力量来自于从黑暗之海拿回的黑暗徽章以及被封印的四圣兽的力量。
黑暗徽章的力量，破坏了创始村的机能，一个数码宝贝诞生或重生的机能被破坏了。
听闻创始村被破坏之后，妖女兽带着樱井唯回过一趟创始村。到了创始村之后，她们看到了一个满目疮痍的村子，妖女兽似乎在寻找着一只名为艾力兽的数码宝贝。
它手足无措的大喊着艾力兽的名字。
随着一道强烈电流攻击的出现，艾力兽也登场了。它想一只被惹毛的刺猬一般，低声嘶吼着，“你们这些家伙给我滚出创始村。”
“艾力兽，我是小妖兽啊。我…我进化了，这里怎么了？为什么创始村会变成这样子。”妖女兽慌张地问道。
“小妖兽？”艾力兽愣住了。
似乎怕艾力兽不相信，妖女兽连忙退化成了小妖兽。小妖兽拍拍自己的胸脯说，“我是小妖兽，我回来了。”
“小妖兽，你回来了？”艾力兽猛的抱住了小妖兽埋头痛哭起来，“你怎么才回来啊，你知不知道……”
“哎呀，小妖兽，你没事带着小唯跑来这个鬼地方做什么啊？”南瓜兽带着一堆灾厄兽从树林里冒了出来。
南瓜兽拍了拍身上的树叶，看着眼前拥抱的两兽，眼睛一亮，张开双手兴冲冲地跑过去，“纳尼？你们是在玩抱抱游戏吗？那也算我一个吧。”
小妖兽推开了艾力兽，嫌弃的躲开了南瓜兽的拥抱。
南瓜兽摔倒在地上了，它捂住脸站起来哀怨地开口，“太过分了，你这个负心汉，居然背着我在外面找了新欢，有了新欢就忘了旧爱嘛？”
小妖兽给了南瓜兽脑袋上两个爱的捶捶，“你今天吃错药了？怎么这么恶心我。”
“小妖兽，你和它们认识？”艾力兽左手指着南瓜兽，一脸不可置信的模样。
[不秒了。]
樱井唯觉得事情大条了，她没想到小妖兽居然和创始村的数码宝贝认识。
许是黑暗四天王觉得樱井唯年龄太小听不懂它们的谈话，它们谈论这些事情的时候并未提防着樱井唯，又或者说是故意让樱井唯知道这些事情。而小妖兽则是每次都被南瓜兽拉去玩游戏，不参加会议，因此它不知道创始村是黑暗四天王的杰作。
每次樱井唯想告诉小妖兽这些事情的时候，南瓜兽总会蹦出来，打断她们的对话，带着她们去玩游戏转移注意力。
小妖兽察觉到了艾力兽的情绪不对，但还是老实地开口，“对啊，它勉强算是我的小弟吧。”
“小弟？！”艾力兽失声尖叫起来，“你知道它做了什么吗？！你居然收它做小弟？！”
南瓜兽似乎有些不耐烦，“它都收了我做小弟，那肯定是知道的啊，而且你太吵了。”它抬起了右手，“trickortreat。”
在空中出现一巨大南瓜砸向艾力兽。
“暗夜之炎。”
球形暗黑火焰将南瓜的弧线改变，南瓜砸到了一只灾厄兽身上。
“小妖兽大人，你和南瓜兽大人打架能稍微注意一点吗？”因为小妖兽和南瓜兽的脾气比较好，所以那只灾厄兽才敢这么说。
“南瓜兽，你做什么？”小妖兽拽住了南瓜兽的领子。
“小妖兽大人？啊…原来如此啊。”艾力兽似乎想通了什么，它怒不可遏，像孔雀一般地打开了身后的尾巴，“不愧是病毒种啊，背叛了友人，居然还在友人面前演戏啊，耍我很好玩吗？小妖兽！”
“闪烁雷击。”
艾力兽的尾巴发射出强烈电流，电流朝小妖兽攻去。
“艾力兽？！”小妖兽甩开南瓜兽，纵身躲过了艾力兽的电击，谁知道电击一个转弯，又打到了小妖兽身上。
“艾力兽？！”小妖兽惊诧万分。
[为什么艾力兽会攻击我？]
“小妖兽——”樱井唯连忙跑到小妖兽的身旁，她对着艾力兽说道，“这件事情，小妖兽它是不知情的，它是蒙在鼓里的。”
“被选召的孩子？”艾力兽歪着头狐疑地开口。
“哈？被选召的孩子？”南瓜兽捂住肚子大笑起来，“那边那只艾力兽啊，你可别误会啊，这个孩子可是我们这一边的呢，创始村被毁她也出了一份力呢。”
[樱井唯兽？它毁了创始村？]
“你以为我会信吗？不过是一个孩子，怎么可能会有毁掉创始村的力量。”艾力兽不相信南瓜兽的说辞。“啊，难道说，你们欺骗了这个孩子和小妖兽吗？”
“欺骗？哎呀，我才不是那种骗人的数码宝贝呢。”南瓜兽撇嘴说道。
小妖兽望着眼前脸色担忧的樱井唯，又想起之前南瓜兽的举动以及她说的那句，「小妖兽它不知情，是被蒙在鼓里的。」
小妖兽握住了樱井唯的手，质问道，“樱井唯兽，你果然是知道这件事情的吧，之前想告诉我，但是被南瓜兽打断了，对吗？”
“对不起。要是我早点告诉你就好了。”樱井唯愧疚极了。
[我真是一个差劲的人啊。]
[之前就应该和小妖兽讲的。]
[要是我说了，也就不会出现这种情况了。]
小妖兽缓缓的闭上了眼睛，然后睁开眼睛，它右手摸了摸樱井唯的头，柔声安慰道，“这不是你的错。”
“樱井唯兽，把你的力量借给我吧，我要进化。”小妖兽坚定的目光看着樱井唯。
“我知道了！”樱井唯拿手捂住进化钥匙。
一道灰紫色的光芒闪现，小妖兽进化成了妖女兽。
“血蝙蝠。”
妖女兽释放出火蝙蝠群将灾厄兽们烧尽。
“妖女兽，你在做什么？”南瓜兽瞪大眼睛，气愤地开口。
“妖女兽？”艾力兽忽然笑出声来，左手抹掉眼角的泪水。“这家伙，还是我认识的那个小妖兽啊。”
“眩晕鞭。”
妖女兽右手放出强烈电击鞭子，将南瓜兽击晕。右手抱住樱井唯，左手拎着南瓜兽，飞了起来。
“艾力兽，你找个地方躲起来，这件事情我会给你一个交代的。”
说完，妖女兽就朝黑暗龙卷山飞去。
留在原地的艾力兽握紧了拳头，它喃喃道，“要活下来啊，小妖兽。还有——”
“对不起。”
这句道歉随风消散，无人听到。
另一边妖女兽带着樱井唯和南瓜兽，怒气冲冲地去找黑暗四天王对质。
“你们黑暗四天王是疯了吗？居然毁了创始村。”
“你们难道不知道创始村的重要性吗？”
“那可是数码宝贝诞生，死去的数码宝贝重生的地方啊！”
“你们怎么敢？！”
对于妖女兽的悲愤填膺，黑暗四天王不屑一顾。
“毁都毁了，问这些也没有用啊。”木偶兽觉得无语。
“妖女兽，你果然还是那么有趣呢。”小丑兽皮笑肉不笑。
“拥有正义感的病毒种吗？倒是很少见。”钢铁海龙兽重新打量了妖女兽。
“血蝙蝠——”妖女兽怒不可遏地发起了攻击。
带有紫色气旋的暗红色蝙蝠群朝黑暗四天王攻去。
“无限大炮。”
机械邪龙兽肩背上的两门大炮发射出超弩级能源波，拦下了蝙蝠群，能源波直击妖女兽。
“妖女兽！！！”
樱井唯跑到晕倒过去的妖女兽身旁。
“你们不要太过分了。”
“哎，驯服不听话的狗虽然会很意思，不过，我想到了一个更有趣的玩法。”小丑兽露出一个意味不明的笑容。
“喂，人类，这里可是我们的地盘，像之前那样乖乖可以活得久一点哦。”木偶兽移到樱井唯面前，抬起樱井唯的下巴，给了她一个忠告。
“啧，这么麻烦，不如直接杀了她。”钢铁海龙兽提议道。
[杀……杀？]
樱井唯听到这一句话才意识到了自己的处境，最近安稳的生活让她几乎忘了自己的处境了。
[我现在不过是一个软弱无力的小孩。]
[虽然我如今是一堆数据……]
[但是我不能赌，已经死过一次的我……]
[被上帝怜爱的我，可不能再次轻易的死去。]
小丑兽似乎被我的表情愉悦了，它笑着说道，“那可不行呢，这个小孩还有用。还不能杀了她。”
钢铁海龙兽啧了一声便离开了。
“真无聊，我还以为你会被咔嚓掉了呢。”木偶兽做了一个抹脖子的动作。
樱井唯一脸冷漠的看着木偶兽，这个时候要她露出慌张的模样只会让这些数码宝贝更兴奋。
“不要这么严肃嘛，撒。来跳舞吧。”木偶兽摊开手，在微弱的灯光照射下，它的手指上连着细细的丝线。
[啊，又来了，这个家伙的恶趣味。]
樱井唯的身体不受控制地跳起了奇怪的舞步。
小丑兽喝了口红酒，打了个响指。“南瓜兽，去把分子兽找过来。”
“是，小丑兽大人。”不知何时醒过来的南瓜兽鞠了个躬，就退下了。
……
樱井唯觉得分子兽是一个十分擅长处理数据，甚至有些可怕的数码宝贝。
分子兽居然复制出了一只听令于小丑兽的妖女兽。
小妖兽被关了起来，小丑兽告诉樱井唯，只要她领着复制的妖女兽打败其他被选召的孩子，她便可以救出小妖兽。否则小妖兽只有被破坏数据的下场了，在创始村被破坏的情况下，小妖兽死了，就很难再复活了。
她别无选择，只能答应。
三个月来，樱井唯被迫和妖女兽一起去制服那些不服黑暗四天王管理的数码宝贝，逆黑暗四天王者亡，在目睹了一个个数码宝贝被杀之后，樱井唯已经麻木了。
三个月里，她想方设法，在南瓜兽的帮助下，她终于找到了小妖兽被囚禁的地方。
正当她想办法要去劫狱的时候，出人意料，在这个时间段，被选召的孩子们再次回到了数码宝贝世界。