金司帝国官制分为两大系统：文官与武官。

文官系统：

宰相是朝廷最高的行政长官。宰相之下有宰相史若干，从事秘书工作，长史为其长。

相助作为宰相之副，其职掌有二：一为掌管天下文书图籍、呈递公卿秦章，颁布皇帝诏令等，类似皇帝的机要秘书长；二是掌管朝廷内外监察，为全国最高的监察长官。

相助之下有相助辅佐若干人，具体负责对朝廷百官的监察以及掌管国家收藏图书档案；同时统管地方的监察长官探问。

地方行政建制分为省、府、镇，其主要长官依次为省长、府长与镇长，辅助主要长官的称为辅佐。

地方各省有天耳，负责督察地方官员。

省、府与镇的警备部队归帝国太保部调遣，太保部负责帝国的治安工作。

武官系统：

金司帝国设置金、黄、紫、蓝、黑五军都督府，各设左、右都督为其长官。五军都督府分别掌管京师及各地军团的军队，都督由皇帝直接任命。

同时金司帝国存在着由皇家贵族子弟组成的贵族军团，设军团长为其长官，军团长由皇帝直接任命。

负责皇宫安全的是皇家亲卫军团，一般由皇帝直接指挥。

另外金司帝国允许存在家族军团，但是单支家族军团编制为10万人，禁止超编，同时家族军团中的高级武官金卫与红卫由朝廷派人充任。家族军团的最高长官为军团长，家族军团的军团长一般由家族中的重要人物担任，同时授予元帅的军衔。

金司帝国军衔分为：元帅、上将、中将、准将、国尉、省尉、府尉与镇尉。